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2011 Enero 11 2011 Articulo (desdefacebook perfil hpcwire), sirve ejemplo dedensidad de datos<http://www.hpcwire.com/features/The-UCSF-Institute-for-Human-Genetics-analyzes-7-petabytes-of-data-with-help-from-Dell--113103349.html> DICE : " 96-array plate, which accommodates saliva samples from 96 patients, contains about one terabyte of data. We’d need 1,042 plates to handle just our initial test size of 100,000 patients—so the complete project will involve more than 7 petabytes of data (PB = equivale a 1015 bytes). We needed to figure out how we were going to be able to store and process all this information.”..."Explains Dispensa: “This operation isrunning 24×7, 365, and it won’t stop until about two years from now"
001. 04.50 "when possible (notincluding floating point operations or use of multipliers)" OJO LO QUE ESTA EN ESOS RENGLONES TAMBIEN ES IMPORTANTE
:) Me en contre un ejemplo de multipier at <http://www.altera.com/support/examples/vhdl/vhd-unsigned-multiplier.html>
002. Ejemplos de VHDL desde ALTERA: <http://www.altera.com/support/examples/vhdl/vhdl.html>, JERARQUOA EJEMPLO<http://www.altera.com/support/examples/vhdl/v_hier.html>
003. INVENTARI EQUIPOS ALBORATORIO UTP 2009 APARECE EL ALTIX
<http://www.utp.edu.co/php/planeacion/docsFTP/documento_condiciones_iniciales-UTP-Julio-2009_final_1.pdf>
004. DITE DEL AUTOR DEL ARTICULO DE IEEE DE ABRIL 16 K10 ( KGB) <http://home.agh.edu.pl/~wielgosz/>
005. ALGORITMO INTERESANTE <http://en.wikipedia.org/wiki/Package-merge_algorithm> VER "Check "FPGA Implementation of the Dynamic Huffman Encoder", Ernest Jamro, Maciej Wielgosz, Kazimierz Wiatr"
006. Adecuaciones electricas Supercomputador 2006 <http://www.utp.edu.co/rectoria/rectoria.php?tipo=9&&id=42>
007. Comando scp para copiar archivos al super <http://josearrarte.com/blog/2009/07/29/copiar-archivos-utilizando-scp-en-linux/>
008. Conexion SSH, comando SCP, SERVIDOR SSH <http://www.guia-ubuntu.org/index.php?title=Servidor_ssh>
008.1 "SSHFS o montar directorio remoto con SSH"
008.2 SSHFS" turorial linux magazine <http://www.linux-mag.com/id/7820>
008.3 SSHFS "Para ahcer backups" <http://rimuhosting.com/howto/sshfs-rdiff-backup.jsp>
009. Ubuntu quitar añadir aplicaciones <http://www.guia-ubuntu.org/index.php?title=A%C3%B1adir_aplicaciones>
010. Descomprimir / comprimir archivos .tar.gz <http://pacodebian.iespana.es/comprimir.html>
011. Algunos comandos de linux <http://www.ajpdsoft.com/modules.php?name=news&file=article&sid=155>
012. SObre stepping level en fpga Virtex II <http://www.xilinx.com/support/documentation/data_sheets/ds031.pdf>
012.0 Sobre el significado de Stepping level <http://www.xilinx.com/support/answers/20947.htm>
013. Mostrar archivos ocultos desde consola <http://www.alejandrox.com/2007/05/mostrar-archivos-ocultos-en-ubuntu-gnome/>
014. BITGEN Overview (Toma NCD: Native Circuit Description) <http://www.xilinx.com/itp/xilinx6/books/data/docs/dev/dev0121_18.html>
014.1 TRACE Overview <http://www.xilinx.com/itp/xilinx6/books/data/docs/dev/dev0104_16.html>
014.2 PAR <http://www.xilinx.com/itp/xilinx6/books/data/docs/dev/dev0075_13.html>
014.2.1 PAR <http://www.xilinx.com/itp/xilinx6/books/data/docs/dev/dev0082_13.html>
014.2.2 PAR <http://www.xilinx.com/itp/xilinx7/books/data/docs/dev/dev0085_14.html>
014 MAP <http://www.xilinx.com/itp/xilinx7/books/data/docs/dev/dev0065_12.html>
014.3.0 MAP <http://www.xilinx.com/itp/xilinx6/books/data/docs/dev/dev0061_11.html>
014.3.1MAP OPTIONS <http://www.xilinx.com/itp/xilinx6/books/data/docs/dev/dev0060_11.html>
014.3.2 MAP Overview <http://www.xilinx.com/itp/xilinx6/books/data/docs/dev/dev0056_11.html>
014.4 NGDBuild <http://www.xilinx.com/itp/xilinx6/books/data/docs/dev/dev0045_9.html>
014.5 XST <http://www.xilinx.com/itp/xilinx6/books/data/docs/dev/dev0028_7.html>
014.5.1 XST Synthesis over View(VER 10.1) <http://www.xilinx.com/support/documentation/sw_manuals/xilinx11/ise_c_using_xst_for_synthesis.htm>
014.5.2 DRC OVER VIEW <http://www.xilinx.com/itp/xilinx7/books/data/docs/dev/dev0078_13.html>
014.5.0 SISTESIS CON SYNPLIFY & PRO (pag xilinx) <http://www.xilinx.com/support/documentation/sw_manuals/xilinx11/ise_p_using_synplify_for_synthesis.htm>
014.5.0.1 SYNPLIFY TABLA DE COMPARACION "Synplify - PRo - Premium " <http://www.synopsys.com/tools/implementation/fpgaimplementation/fpgasynthesis/pages/synplifyfeaturecomparisonchart.aspx>
014.5.0.1.1 AMPLIFY from synplicity para optimizar en FPGA <http://www.synplicity.jp/literature/pdf/amplify_351_rnotes.pdf>
014.5.0.1. VER AQUI NOMBRAN AMPLIFY <http://www.synopsys.com/community/universityprogram/pages/extnwsecurity.aspx>
014.5.1 DESIGN ENTRY AND SINTESIS <http://www.xilinx.com/itp/xilinx6/books/data/docs/dev/dev0015_5.html#wp235868>
014.5.2 desing flow overview (LAS FIGURAS ! 2-1 &2-2 )<http://www.xilinx.com/itp/xilinx6/books/data/docs/dev/dev0014_5.html>
014_OTRA COSA. Articulo realcionado con TAR.GZ muy bueno <http://www.linux-mag.com/id/7825>
015. IMPLEMENTACION Y SINTESIS HELP XILINX <http://www.xilinx.com/itp/xilinx8/help/iseguide/iseguide.htm#html/ise_fpga_design_flow_overview.htm>
015.1 ISE ADVANCED <http://www.xilinx.com/itp/xilinx8/help/iseguide/html/ise_advanced_flow.htm>
015.2 ISE INCREMETNAL <http://www.xilinx.com/itp/xilinx8/help/iseguide/html/ise_incremental_design_flow.htm>
015.3 ISE BASICO <http://www.xilinx.com/itp/xilinx8/help/iseguide/html/ise_basic_flow.htm>
015.4 Xilinx ISE Tools TUTORIAL <http://web.mit.edu/6.111/www/s2004/NEWKIT/ise.shtml>
016. CONFERENCIA HPRC EN NOVIEMBRE <http://www.ncsa.illinois.edu/Conferences/HPRCTA10/>
017. OPEN FPGA <http://www.openfpga.org>
018. SGI AT 2007 <http://www.youtube.com/watch?v=g6e1ByCD3pU>
019. IPAD Y ALTIX <http://www.datacenterknowledge.com/archives/2010/10/04/using-an-ipad-to-manage-a-supercomputer/>
020. EXELENTE ENTRENAMIENTO EN HPC <https://computing.llnl.gov/?set=training&page=index> [OCT 6 K10]
020.1 Granularidad Fine_grain Coarse-grain <https://computing.llnl.gov/tutorials/parallel_comp/#HybridMemory>
021. XILINX MANUALES DE ITERES <http://www.xilinx.com/support/sw_manuals/xilinx8/index.htm>
021.1 Xilinx ISE 8 Software Manuals and Help - PDF Collection <http://www.xilinx.com/itp/xilinx8/books/manuals.pdf>
021.2 Xilinx Manuales DOWNLOAD <http://www.xilinx.com/support/sw_manuals/xilinx8/download/> [Constraints Guide, Development System Reference Guide, XST User Guide Y OTROS MAS !]
022. Estado del arte Brasil con SGI <http://www.marketwatch.com/story/university-of-sao-paulo-accelerates-drug-research-with-sgir-altixr-xe-2010-10-04>
022.1 Dengue Brasil SGI <http://www.who.int/mediacentre/factsheets/fs117/en/index.html>
023 Mas sobre supercomputación <http://sc10.supercomputing.org/?pg=vidcontribute.html>
024.0 sudoku solver <http://www.blake-foster.com/project.php?p=26>
025. SSH for Blackberry esot es lo que quiero <http://appworld.blackberry.com/webstore/content/reviews/7070>
025.0 ademas lo uno con dropbox ! this is mine ! ! <https://www.dropbox.com/blackberry>
025.1 Este SSH esta mejor creo que es gratis <http://www.thegeekstuff.com/2009/04/midpssh-blackberry-ssh-client-tutorial-connect-to-unix-server/>
025.1.1 Ver <http://www.xk72.com/midpssh/>
025.1.2 Ver <http://marcparadise.com/articles/tag/bbssh>
025.2 BBSSH.org <http://bbssh.org/wiki/en/Home>
025.3 BBSSH Twitter <http://twitter.com/bbssh>
025.4 BBSSH blog <http://bbssh.org/blog/>
026 MAKEFILE Y MAKE comando
026.0 Makefiles tutorial ejemplos <http://mrbook.org/tutorials/make/>
026.1 GNU MAKE <http://www.gnu.org/software/make/manual/make.html>
026.2 a simple makefile tutorial <http://www.cs.colby.edu/maxwell/courses/tutorials/maketutor/>
027. AMPLIFY from synplicity para optimizar en FPGA <http://www.synplicity.jp/literature/pdf/amplify_351_rnotes.pdf>
028 Editor vi : Comandos rapidos: <http://iie.fing.edu.uy/~vagonbar/unixbas/editorvi.htm#BasicoVI>
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029 TERMINAL "consola de comandos" <http://www.guia-ubuntu.org/index.php?title=El_Terminal>
030 ISE Design Suite 10.1 (Instalación en linux) Release Notes <www.xilinx.com/itp/xilinx10/books/docs/irn/irn.pdf>
031 GEDIT <http://www.guia-ubuntu.org/index.php?title=GEdit>
FIN ! NOVIEMBRE 11 DE 2010
Noviembre 23 2010 crecimiento de FPGA from HPC <http://www.hpcwire.com/features/The-Expanding-Floating-Point-Performance-Gap-Between-FPGAs-and-Microprocessors-109982029.html>
Noviembre 23 2010 IP +,- ,/ ,* , sqrt() para FPGA (ver programa en c++)<http://www.xilinx.com/support/documentation/ip_documentation/floating_point_ds335.pdf>
GPU CPU FPGA ALGORITMO DESCARGAR Smith-Waterman algorithm implementation on CPU, GPU and FPGA <http://sourceforge.net/projects/sw-cpu-gpu-fpga/>
SOBRE JOHN PASTA <http://ciencianet.com.ar/138/el-problema-de-fermi-pasta-y-ulam-un-peque-o-descubrimiento>
JOHN PASTA <http://en.wikipedia.org/wiki/John_Pasta>
2011
Enero 11 2011
Articulo (desde facebook perfil hpcwire), sirve ejemplo de densidad de datos <http://www.hpcwire.com/features/The-UCSF-Institute-for-Human-Genetics-analyzes-7-petabytes-of-data-with-help-from-Dell--113103349.html> DICE : " 96-array plate, which accommodates saliva samples from 96 patients, contains about one terabyte of data. We’d need 1,042 plates to handle just our initial test size of 100,000 patients—so the complete project will involve more than 7 petabytes of data (PB = equivale a 1015 bytes). We needed to figure out how we were going to be able to store and process all this information.”..."Explains Dispensa: “This operation is running 24×7, 365, and it won’t stop until about two years from now"
Enero 22 de 2011 ( Vaya si han sucedido eventos !!! :) que planteamientos nos presenta la vida o en la vida )
NSF Center for High-Performance Reconfigurable Computing <http://chrec.org/>
Febrero 21 de 2011 (Un mes casi y los asuntos del alma como que van entendiendo )
1. Comandos para monitoreo de usuarios conectados en linux "last" "who" "finger"<http://foro.elhacker.net/tutoriales_documentacion/iquestcomo_puedo_saber_si_un_sistema_linux_ha_sido_comprometido-t21932.0.html>
2. Getting Started with the Intel(R) C++ Compiler Professional Edition 11.1 for Mac OS* X <http://software.intel.com/sites/products/documentation/hpc/compilerpro/en-us/cpp/mac/start/getting_started_c.pdf>
3. HolaMundo <http://www.chuidiang.com/clinux/herramientas/basico/hola_mundo.php>
Febrero 23 de 2011
1. VIIDEO: HPC 101: Concurrency, Parallelism and You (Part 1) <http://www.youtube.com/watch?v=qNg3XXvgTdQ&hq_e=el>
1.1 (Part 2) <http://www.youtube.com/watch?v=hCmBhFXWjl0>
2. VER ESTAS CLASES SON BUENAS <http://www.youtube.com/watch?v=L2ur8VMmxK8>
3, Manual Configurar MPI y OpenMP Con Lenguaje CC-y-Fortran-Usando-KDevelop<http://es.scribd.com/doc/12083106/Manual-Configurar-MPI-y-OpenMP-Con-Lenguaje-CC-y-Fortran-Usando-KDevelop> (ej: gcc -pg -fopenmp -o open2 openmp_sample.c)
4. SGI OPENMP con ejemplos <http://techpubs.sgi.com/library/dynaweb_docs/0630/SGI_Developer/books/CLanguageRef/sgi_html/ch10.html>
4.1 ver todo el manual : C Language Reference Manual [Document Number: 007-0701-130] <http://techpubs.sgi.com/library/dynaweb_docs/0630/SGI_Developer/books/CLanguageRef/sgi_html/index.html>
5. SGI® Altix™ Tuning OpenMP Parallelized Applications <http://wwwuser.gwdg.de/~parallel/parallelrechner/altix_documentation/altix_tuning_openmp.pdf>
6. SGI® Altix™ Single CPU Optimization nombra las librerías SCSL MKL<http://tu-dresden.de/die_tu_dresden/zentrale_einrichtungen/zih/veranstaltungen/nutzerschulungen/dateien/altix_single_cpu_optimization.pdf>
Febrero 24 de 2011
1. ClusterNumbers: An Automated Benchmarking Tool for HPC Clusters <http://www.hpcwire.com/features/ClusterNumbers-An-Automated-Benchmarking-Tool-for-HPC-Clusters-116745699.html?viewAll=y>
2. SGI® Altix® 450<http://www.sgi.com/products/servers/altix/450/configs.html>
3. Obtener informacion sobre numero de cores en el supercompu, escribir: <grep 'processor.*:' /proc/cpuinfo | wc -l> (quitar < > )
3.1 Obtener espacio en Disco DUro
3.2 Obtener cantidad de RAM < grep "MemTotal:" /proc/meminfo>
3.3 BUscar una cadena partiendo del directorio raiz: <find / cadena>
4 openMP TUTORIAL 1 : <https://computing.llnl.gov/tutorials/openMP/>
4.1 openMP TUTORIAL 2: <http://www.nersc.gov/nusers/help/tutorials/openmp/>
4.2 openMP en 30 minutos (requiere mi clave de acceso): <http://www.linux-mag.com/id/4609/>
MArzo 16 de 2011
1. Colombia GRID Supercomputación <http://sc3.uis.edu.co/index.php/Infraestructura>
1.1 Ejemplo conexión <http://sc3.uis.edu.co/index.php/Inicio_Usuarios>
Marzo 28 de 2011
1. Entendiendo la Computación Paralela <http://www.linux-mag.com/id/8515/?hq_e=el&hq_m=1215945&hq_l=12&hq_v=95e24429de>
Mayo 16 de 2011 SHARED MEMORY tarjeta que permite lograrlo para closter <http://www.numascale.com/numa_smp_adapter.html>
Junio 28 de 2011
1. Command Line Magic: Scripting, Part One escrips linea de comando
<http://www.linux-mag.com/id/8747/?hq_e=el&hq_m=1279726&hq_l=10&hq_v=95e24429de>
2. Command Line Magic: Scripting, Part Two escrips linea de comando <http://www.linux-mag.com/id/8797/?hq_e=el&hq_m=1282755&hq_l=10&hq_v=95e24429de>
sudoku 32 node cluster <https://makebettercode.com/automaticparallelism_rockstar/receipt.php?campaign=sudoku_RS&language=english>
Agosto 14 de 2011
Excelente esto: diseñan pàra fpg crean el makefile <https://www.boldport.com/>
FPGA Y GPU EN EL MISMO SISTEMA <http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0743731511001493>
OCUTBRE 17 2011
SGI RGB IMAGE FORMAT <http://paulbourke.net/dataformats/sgirgb/>
DICIEMBRE 8 2011
FPGA Reconfigurable Data Processing for Clouds <http://blogs.msdn.com/b/satnam_singh/archive/2011/01/18/reconfigurable-data-processing-for-clouds.aspx>